По состоянию на 01.01.2017 в бюджет города для программного финансирования на 2017 год включено 20 муниципальных программ, общий объем финансирования которых составил более 601 млн. рублей. В 2016 году завершили свое действие муниципальные программы: «Поддержка и развитие малого и среднего предпринимательства в городе Рубцовске» на 2014-2016 годы и «Переселение граждан из аварийного жилищного фонда в городе Рубцовске» на 2013-2016 годы.
На основании решения Рубцовского городского Совета депутатов Алтайского края от 15.12.2016 №799 «О бюджете муниципального образования город Рубцовск Алтайского края на 2017 год», и руководствуясь постановлением Администрации города Рубцовска Алтайского края «Об утверждении Порядка разработки, реализации и оценки эффективности муниципальных программ муниципального образования город Рубцовск Алтайского края», в действующие муниципальные программы ответственные исполнители (разработчики) муниципальных программ обязаны внести соответствующие изменения (объемы финансирования, мероприятия, индикаторы).