Основателем и бессменным руководителем Музея был и остается главный врач городской больницы №2 Иван Беккер. Благодаря многолетним стараниям Ивана Генриховича Музей имеет массу уникальных экспонатов, рассказывающих об истории становления медицины на Алтае.
Фонды музея насчитывают более 10 тыс. экспонатов: исторические реликвии, старинные инструменты и лекарственные средства – редкие на Алтае. Отдельные экспозиции раскрывают суть народной медицины – это и баня, как первая славянская лечебница, и убранство крестьянской избы. Широко представлены материалы об участии медицинских работников в Великой Отечественной войне, воссозданы операционная и палата передвижного госпиталя.
В залах музея можно ознакомиться с оснащением аптеки первой половины XX века, лекарственной флорой Алтая, становлением санаторно-курортной службы; заглянуть в микроскоп столетней давности. Объемно представлен материал о медицинском образовании на Алтае – это история АГМУ, отдельных кафедр, медицинских училищ.
Музей – кладезь информации для студентов городских ссузов и вузов, особенно для учащихся Рубцовского медицинского колледжа.
В 1999 году Музей истории медицины Алтая переведён из цокольного этажа здания по пер.Коммунистический, 35 в двухэтажное здание по адресу пер.Коммунистический, 16 (Постановление администрации Рубцовска №1691).
И хотя 20 лет – возраст для музея, можно сказать совсем юный, он завоевал очень широкую известность как в Рубцовске, так и далеко за его пределами.